투명한 프로세스 자동화로 실험실의 워크플로는 가속화되고, 신속한 NGS용 SLIMS 구현 프로세스로 비즈니스 결과를 보다 빨리 실현할 수 있습니다. 예로서 DNA를 추출하고 Novaseq에서 Agilent SureSelect XT 키트를 실행해야 할 경우, 단 몇 분 안에 기본 워크플로를 배포할 수 있습니다.
차세대 시퀀싱(NGS)용 Agilent SLIMS
NGS 워크플로를 통합하고 간소화하세요
NGS 데이터 및 워크플로를 쉽게 추적
간단한 해결책이 있는데 정보 과부하로 계속해서 씨름하실 이유가 있나요? SLIMS는 모든 실험실 정보를 제어하고 시간, 비용 및 소모적인 작업을 줄일 수 있는 단일 시스템입니다. SLIMS는 기존의 LIMS(실험실 정보 관리 시스템)보다 배포가 쉽고 빨라, 전체 시료 관리 프로세스를 보다 능동적으로 통합, 자동화 및 시각화할 수 있습니다. 빠른 SLIMS의 도입으로, 실험실의 오늘과 내일에 더 많은 이점을 누리세요.
시작하기NGS용 SLIMS의 장점
NGS 기기 연결
HIPAA, CLIA, CAP 등의 규제 준수 간소화
메타데이터 기록 및 보고 자동화
대량의 시료 데이터를 시각적으로 추적
무한한 작업 구성
쉬운 액세스 권한 관리
엔드 투 엔드 시료 관리
NGS용 SLIMS는 최고의 LIMS와 NGS 워크플로 관리 기능을 결합합니다. 포인트 앤 클릭 자동화는 Agilent Alissa Interpret와의 통합으로 주문 생성에서 변형 분석까지 사용자에게 수행할 작업을 지시하여 전체 파이프라인을 용이하게 합니다. 한 단계에서 다른 단계로 진행되는 시료 관리, 위치와 할당 추적, 복잡한 워크플로에 대한 가이드라인 확인, 예외별 검토 및 지연 없는 공동 작업을 원활하게 수행할 수 있습니다. SLIMS는 또한, 뛰어난 적용성으로 실험실의 고유한 프로세스에 맞게 쉽게 구성할 수 있습니다.
SLIMS를 사용하면, 실험실 직원은 시료 관리 프로세스의 모든 단계를 추적하고 모든 관련 콘텐츠에 대한 경로를 찾을 수 있습니다. 다음 기능을 제공합니다.
- 수신부터 저장, 전달까지 추적
- 언제나 모든 위치의 관리 체인 추적
- 유연한 시료 메타데이터
- 표준물질 및 시약에 대한 사용 추적과 재고 관리
- 유도, 분취(aliquoting), 혼합(풀링)
- 실험실에서 무엇이든 쉽게 찾을 수 있도록 맞춤형 라벨 및 바코드 인쇄
통합 및 자동화를 통한 유연성
NGS용 SLIMS는 하나의 자동화 시스템으로 전체 NGS 워크플로를 지원합니다. SLIMS Store 모듈에서 시료, 플레이트, 분석 및 기기를 쉽고 빠르게 통합하는 구성을 클릭만으로 다운로드할 수 있습니다. 인덱스 플레이트는 임의의 순서로 다운로드하고 재구성할 수 있습니다. 키트를 선택하면, SLIMS가 워크플로, 시약 및 어댑터 바코드를 설치합니다!
주요 공급업체의 인덱스 세트
SLIMS는 Agilent SureSelect, Illumina Nextera XT, BGI, 10x Genomics 등에 대한 인덱스 세트를 제공합니다.
사용자 정의 세트의 업로드는 간단하며 Excel을 이용해 수행할 수 있습니다. SLIMS가 워크플로에서 시료 플레이트에 적용할 어댑터 플레이트를 제안하도록 하세요.
주요 공급업체의 인덱스 세트
- 설계된 간편한 SLIMS 플러그인을 사용하여 EMR(전자 의료 기록)과 완벽하게 통합
- SLIMS Store에서 애질런트 플러그인을 다운로드해 시료 시트를 생성하고 NGS QC에서 결과를 가져옵니다
- 애질런트의 핵심 시퀀싱 워크플로를 사용하여 시퀀싱 기기인 Illumina BaseSpace와 통합
- SLIMS API를 사용하여 자체 데이터 파이프라인과 원활하게 연결
워크플로 자동화
SLIMS를 사용하면 이전의 수동 프로세스를 쉽게 자동화하여 효율성을 높이고 오류를 줄일 수 있습니다. 워크플로의 시료에 새 요청을 추가하고 대조 시료 추가를 자동화하고 규칙을 적용하여 풀과 보관에 대한 검증을 수행할 수 있습니다. 포인트 및 클릭으로 DNA/RNA 추출, 라이브러리 준비, QC, 정규화, 풀링 및 시퀀싱과 같은 광범위한 프로토콜을 추가할 수 있습니다.
전체 워크플로의 가시성
SLIMS는 시각적이고 직관적이며 사용이 쉽습니다. 전체 작업 흐름 또는 그 일부에 대한 최신 그래픽 보기를 제공하여, 사용자는 항상 자신의 할 일 목록에서 현재 진행 중인 작업과 그 다음 작업을 확인할 수 있습니다. 더 이상 관련 없는 데이터 및 작업을 정렬하지 않아도 됩니다.
그래픽 인터페이스는 콘텐츠 생성 및 필터링을 간단하게 합니다. 사용자는 표시할 콘텐츠를 사용자 지정하고, 고유 식별자, 콘텐츠 유형 및 상태와 같은 모든 시료 속성을 보고, 속성을 수정하고, 변경한 사람과 변경 날짜 및 시간을 포함한 원본 콘텐츠의 모든 변경 사항을 확인할 수 있습니다. 이는 21 CFR part 11 준수 의무를 충족하는 데 도움이 됩니다. 예를 들어 특정 프로토콜 유형에서 처리 중인 시료 수를 즉시 확인할 수 있습니다. 어느 항목이든 클릭하면 해당 프로토콜로 직접 연결되어, 작업을 시작 또는 계속하거나 완료된 작업을 검토할 수 있습니다. SLIMS를 열기만 하면 작업을 시작하거나, 검토할 수 있습니다.
안정적이고 확장 가능한 데이터 관리
NGS용 SLIMS는 데이터를 위한 원스톱 센터입니다. 이 시스템은 시료와 데이터를 한 곳에 통합합니다. 권한이 있는 실험실 직원과 관리자는 데이터에 즉시 액세스할 수 있으며, 심지어 다양한 시간대와 다양한 장소의 실험실에서 원격으로도 데이터에 액세스할 수 있습니다. SLIMS 아키텍처는 데이터 집약적이거나 복잡한 워크플로의 요구 사항을 충족하도록 확장됩니다. 항상 필요한 저장 공간과 수집한 항목을 안정적으로 정리할 수 있습니다. 그리고 이러한 작업을 디지털 방식으로 자동 수행하여, 보다 일관되고 높은 품질의 감사하기 쉬운 결과를 생성할 수 있습니다.
즉시 작동 가능
NGS용 SLIMS는 유연한 설치 옵션을 제공합니다. 확장 가능하고 강력하며 안전한 애질런트 서버 또는 귀하가 원하는 클라우드 서비스 제공업체가 호스팅할 수도 있으며 귀하의 IT 인프라 내 서버에도 설치할 수 있습니다. NGS용 SLIMS는 웹 브라우저에서 실행되고, 클라이언트 컴퓨터에서 추가 소프트웨어가 필요하지 않으며, 태블릿에서도 사용할 수 있습니다.
더 빠른 결과
전문성
Agilent SLIMS 엔지니어는 과학 및 실험실 정보학 분야의 도메인 전문가입니다. 애질런트는 20개국 이상 국가에 실험실용 솔루션을 배포했습니다. 설치, 구성에서 검증 및 지속적인 지원까지 애질런트는 프로젝트의 모든 단계에서 귀하를 지원합니다.
SLIMS 스토어
SLIMS 스토어는 빠른 구현을 위해, 사전 구성된 도구에 대한 액세스를 제공합니다. 시료 유형, 위치, 메타데이터, 자동화 스니펫 등의 다양한 라이브러리를 선택하여 솔루션을 최대한 빠르게 작동할 수 있으며, 필요한 것을 설치하고 있는 그대로 사용하거나 실험실에 맞게 SLIMS를 조정할 수 있습니다.
사용 후기
SLIMS에 대한 현장의 사용 후기를 확인하세요
"SLIMS는 시약, 항체, 마우스 등, 모든 것에 대한 다양한 관리 시스템을 하나의 시스템에 통합하였습니다. 캡처에서 이전과는 달리 더욱 깊이 있고 풍부한 정보를 확인할 수 있습니다.”
“SLIMS의 기능은 다른 병원에서 오는 시료를 추적하고 대상을 시료, 프로토콜 및 결과에 연결하여 우리 병원을 지원하며 주문 등록, 스케쥴링 및 검증을 가능케 합니다. ELN 모듈은 과학자들이 필요한 광범위한 정보는 물론, 실시간 개요를 통해 시퀀싱의 실행을 추적할 수 있으며, 쉬운 단계별 프로토콜을 통해 NGS 분석의 워크플로에서 안내를 제공합니다. 또한 지정된 시료와 그 파생물에 연결된 모든 데이터를 포함하는 시료 및 주문 상태에 대한 실시간 개요를 보여줍니다.”
자주 묻는 질문(FAQ)
차세대 시퀀싱(NGS)은 질병 또는 기타 생물학적 연구 관련된 유전적 변이를 연구하기 위한 고처리량의 대규모 병렬 시퀀싱 기술을 말합니다. NGS는 생물학적 연구에 혁명을 일으킨 체인 종결 시퀀싱 또는 Sanger 시퀀싱을 개선하여, 최초로 연구원들이 게놈 시퀀스를 결정할 수 있도록 합니다.
NGS와 1세대 시퀀싱의 주요 차이점은 처리량입니다. NGS는 실행당 수백만 개의 작은 DNA 조각에 대한 병렬 시퀀싱을 제공합니다. 기존 시퀀싱 또는 Sanger 시퀀싱을 사용하면 시간 소모적인 분석으로 인해 반응당 몇 개의 염기만 해독할 수 있습니다. 부피 및 처리량 향상을 예로 들자면, NGS는 전체 인간 게놈을 하루 만에 시퀀싱할 수 있는 반면, 최초의 인간 게놈을 결정하는 데 사용된 Sanger 시퀀싱 방법의 경우 해당 해독에 10년이 넘는 시간이 걸렸습니다. NGS 처리량의 대폭적인 향상은 또한 DNA 시퀀싱 비용의 극적인 감소로 이어졌습니다.
사용자는 NGS용 모든 실험실 정보 관리 시스템(LIMS)으로 시료 및 관련 데이터를 보다 쉽고 효과적으로 관리할 수 있습니다. 모든 NGS 워크플로에 대해 우수한 LIMS는 다음과 같은 작업을 수행할 수 있습니다.
- HIPAA, CLIA, CAP 및 기타 표준 준수 간소화
- 대량의 시료 데이터를 시각적으로 추적
- NGS 기기 연결
- 느리고 연결이 끊어진 Excel 데이터를 검색할 필요 제거
- 메타데이터 기록 및 보고 자동화
- 무한한 작업 구성
- 3차 분석을 위한 변형 분석 관리
NGS는 고품질의 일관된 데이터를 보장하기 위해 QC 검사를 수행하는 여러 단계의 복잡한 과학 프로세스입니다. 다음과 같은 단계가 포함됩니다.
- 시료 수집
- 시료 전처리
- 라이브러리 준비
- 표적 농축
- 시퀀싱
- 데이터 분석 및 보고
LIMS는 액체 처리기에서 기기, NGS 데이터 분석 소프트웨어까지, NGS 워크플로 전반에서 사용되는 모든 기기와 소프트웨어 패키지를 연결할 수 있습니다. 특히 시퀀서의 경우 기기는 엄청난 양의 NGS 데이터를 생성하고, 이를 저장 및 분석합니다. 그런 다음 LIMS는 주요 결과를 찾아 보고서에 표시합니다.
NGS 실험실은 몇 가지 공통적인 문제에 직면해 있으며, 애질런트 제품 또는 솔루션으로 대부분의 문제를 예방할 수 있습니다.
- 문제: 재사용이 가능한 방식으로 데이터 보관. 솔루션: Agilent SLIMS는 Microsoft Excel과 같은 일반 스프레드시트 시스템에 비해 검색을 편리하게 하며, 시료, 절차, 시료 결과 간 링크를 생성합니다. Excel은 사용이 쉽고 다용도이지만, 정보 검색 또는 정보 구조화 에는 적합하지 않습니다
- 문제: 시료 품질이 언제나 특정 수준인지 확인하며 솔루션: 일반 QC 검사로 시료 품질을 보장할 수 있습니다. 통합 및 자동화된 시료 QC는 Agilent SLIMS와 완전히 통합된 Agilent TapeStation 시스템의 경우와 마찬가지로, NGS 워크플로의 효율성과 사용 편의성에 이상적입니다
- 문제: 라이브러리 준비는 복잡하며 오류가 발생하기 쉽습니다. 솔루션: Agilent SLIMS는 프로토콜을 보다 쉽고 빠르게 설정할 수 있도록 직관적인 제어 기능과 사용자 지침을 제공하면서, 자동화를 통해 오염, 오류 및 시료당 비용을 절감합니다. Agilent Bravo는 NGS 시료 전처리를 자동화할 수 있는 유연한 액체 처리 플랫폼으로, 일관된 데이터를 생성하면서 동시에 시간을 절약합니다
규제 준수를 보장하기 위해 NGS 실험실은 다음과 같은 표준을 충족해야 합니다. HIPAA, CLIA, ISO 13485, ISO/IEC 17025, ISO 15189.
NGS는 전체 게놈 또는 DNA 또는 RNA의 표적 영역에서 뉴클레오타이드의 순서를 결정하기 위해 많은 유전자를 동시에 테스트하는데 사용되는 전략이며 NGS는 변이 또는 돌연변이를 감지하는 데에도 사용할 수 있습니다. 예를 들어 암에서, NGS는 생검 또는 이미 제거된 환자의 종양에 사용될 수 있습니다.
실시간 중합효소 연쇄반응(PCR)은 다중 성능이 제한된, 더 쉽고 덜 까다로운 기술입니다. NGS로 분석가는 정확한 변화를 드러내면서, 많은 유전자 시퀀스를 동시에 분석할 수 있습니다. 그러나 NGS는 PCR보다 기술적으로 더 까다롭고 많은 비용이 필요한 프로세스입니다.
정량적 중합효소 연쇄 반응(qPCR)은 표적 수가 적은 저처리량 실험실에서 가장 잘 작동합니다. NGS는 확장성이 뛰어나고 고처리량 시퀀싱에 더 적합하며, 더 높은 발견 능력과 더 높은 감도를 제공합니다.
DNA 시퀀싱이 개발된 지 수십 년이 지난 지금, 전 세계적으로 10,000개 이상의 NGS 시스템이 설치되었습니다. 차세대 시퀀싱은 이제 현 세대 시퀀싱으로 받아들여지고 있으며, 실험실들은 높은 처리량과 더 높은 체계화를 제공해야 하는 도전에 직면하고 있습니다. 규제 기관도 중요한 역할을 합니다. 실험실이 더 많은 데이터를 기록하고 장기적인 작업에 적응하도록 요구하기 때문입니다. 따라서 생산성에 중점을 두면서 전체 NGS 워크플로를 일관성 있게 관리할 수 있는 디지털 솔루션 구현이 필요합니다.
애질런트는 광범위한 NGS 포트폴리오 외에도 SLIMS를 통해 실험실 워크플로에서 모든 시료를 관리하고 추적하는 포괄적인 소프트웨어 솔루션을 제공합니다. 여기에는 시료 수집 중, 시료 사용 전, NGS 라이브러리 QC, 표적 농축 중에 취해야 할 품질 관리 조치가 포함됩니다. 또한 SLIMS는 데이터를 안전하게 정렬하고 향후 몇 년 동안 액세스가 가능하도록 하는 데 필요한 정교한 제어 기능을 제공합니다.
간단하게 데모를 신청할 수 있습니다.
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