用于二代测序的安捷伦 SLIMS

整合并简化您的 NGS 工作流程

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轻松追溯和追踪 NGS 数据和工作流程

既然有简单的解决方案,为什么还要继续与信息过载作斗争?SLIMS 是让您可以掌控所有实验室信息并节省时间、成本和精力的单个系统。SLIMS 的部署比传统 LIMS(实验室信息管理系统)更快速、更轻松,因此可以主动为您集成、自动化和可视化整个样品管理过程。越早使用 SLIMS,获益越多。

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使用 SLIMS 进行 NGS 的优势

SLIMS 工作流程
与您的 NGS 仪器连接
助您轻松满足 HIPAA、CLIA 和 CAP 等法规要求
自动记录和报告元数据
可视化追踪大量的样品数据
规划无限的任务
轻松管理访问权限
端到端样品管理

用于 NGS 的 SLIMS 结合 LIMS 的优势和 NGS 工作流管理功能。 通过与 Agilent Alissa Interpret 集成,点击式自动化简化了整个流程,指导用户执行从订单创建到变异分析的操作。现在,您可以管理从一个阶段到另一个阶段的样品,追踪位置和分配,接收复杂工作流程指南,进行异常审核,并在不造成延误的情况下促进协作。SLIMS 还具有极强的适应性,可轻松配置以匹配您实验室的独特流程。

SLIMS 允许实验室工作人员追踪样品管理流程的每个步骤,并找到所有相关内容的路径。它能提供:

  • 从样品接收到存储和交付的追踪
  • 所有位置的监管链随时追踪
  • 灵活的样品元数据
  • 标准品和试剂的使用情况追踪和库存管理
  • 衍生、等分、与混合 (Pooling)
  • 自定义标签和条形码的打印,以便在实验室中轻松找到任何物品
通过集成和自动化提供灵活性

使用 SLIMS 进行 NGS,一套自动化系统可以支持您的整个 NGS 工作流程。使用 SLIMS 存储模块,只需单击下载配置,即可快速、轻松地集成您的样品、孔板、分析和仪器。可以按任意顺序下载和重新配置标签板。您只需选择试剂盒,然后 SLIMS 会安装工作流程、试剂和接头条形码!

来自主要供应商的标签集
SLIMS 提供 Agilent SureSelect、Illumina Nextera XT、BGI 和 10x Genomics 等标签集。 可通过 Excel 轻松上传定制标签集。让 SLIMS 建议在工作流程中应用于样品板的转接板。

多仪器

来自主要供应商的标签集

  • 使用设计的简单 SLIMS 插件,与您的 EMR(电子病历)进行无缝集成
  • 从 SLIMS Store 下载我们的插件,生成样品表并从 NGS QC 导入结果
  • 使用我们的核心测序工作流程,与测序仪器 Illumina BaseSpace 进行集成
  • 使用 SLIMS API 无缝连接您自己的数据流程

工作流程自动化
SLIMS 可以轻松实现以前手动操作流程的自动化,从而提高效率并减少错误,您可以向工作流程添加新的样品请求,自动添加对照样品,以及使用规则验证混合与存储。只需点击即可添加 DNA/RNA 提取、文库制备、QC、归一化、混合、测序等广泛的方案。

工作流程 NGS
整个工作流程的可视化

SLIMS 可视化、直观且易于使用。它以图形方式提供整个工作流程或其中任何环节的最新状态视图,因此用户可以随时查看动态并了解下一步操作。 不再对无关的数据和任务进行排序。

利用图形化界面可以轻松创建和过滤内容。用户可以自定义要显示的内容,查看所有样品属性(例如唯一标识符、内容类型和状态)和修改属性,并查看原始内容的任何更改,包括执行更改的人员以及更改日期和时间,从而帮助您履行 21 CFR part 11 合规义务。例如,您可即时了解某一具体方案类型中有多少样品正在处理。单击任何项目,即可进入相应方案开始/继续工作,或查看已完成工作。只需打开 SLIMS 即可开始工作或查看任务。

可靠且可扩展的数据管理

用于 NGS 的 SLIMS 可一站式提供您所需的数据。它将您的样品和数据整合。 使所有授权实验室人员和经理即使在多个时区和多个地点的实验室也可远程即时获取数据。SLIMS 架构可扩展满足数据密集型或复杂工作流程的需求。您始终拥有所需的存储空间,以及可靠组织所收集信息的能力。以数字化方式自动执行数据管理使您可以获得一致性更强、质量更高且审计更轻松的结果。

即时可操作

用于 NGS 的 SLIMS 提供了灵活的安装选择。它可托管在安捷伦强大、可扩展的安全服务器上,也可由您喜欢的其他云服务供应商托管。还可以直接安装到您自有 IT 基础架构中的服务器上。用于 NGS 的 SLIMS 基于网页浏览器运行,无需在客户电脑上安装其他软件,也可在平板电脑上使用。

卡片影像采集

更快获得结果

您实验室的工作流程因流程的自动化和透明化而加速,同时由于使用 SLIMS 进行 NGS 的实施流程非常迅速,您可以更快看到业务结果。例如,如果需要提取 DNA 并在 Novaseq 上运行 Agilent SureSelect XT 试剂盒,可以在数分钟内部署默认工作流程。

卡片影像采集

专业技术

安捷伦 SLIMS 工程师是拥有科学和实验室信息学背景的领域专家。我们为 20 多个国家/地区的实验室部署了解决方案。我们在项目的所有阶段为您提供支持,从安装和配置到验证以及持续的帮助。

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SLIMS Store

SLIMS Store 使您能够获取预配置工具,以便快速实施。从丰富的样品类型、位置、元数据、自动化代码等配置资源库中选择所需,让您的解决方案尽快投入运行。 安装您需要的配置直接使用,或是进行调整以适合您的实验室需要。

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案例研究

了解这位客户如何使用安捷伦 SLIMS 提高效率并推进他的研究。

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自选网络研讨会

了解安捷伦 SLIMS 实验室工作流程平台的基础知识

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产品样本生物样本库

客户评价

听听我们的客户对 SLIMS 的使用体验评价

伦敦国王学院

“SLIMS 将试剂、抗体、小鼠等各种不同的管理系统整合在一个系统中。所捕获的内容具有前所未有的深度和丰富度。”

奥尔堡大学医院徽标

“SLIMS 的功能通过帮助追踪和追溯来自不同医院的样品,将受试者与样品、方案和结果相关联,为我们的医院提供支持。它支持订单的注册、安排和验证。 ELN 模块允许通过实时概览追踪测序运行,同时提供科学家所需的广泛信息,并通过简便易行的分步方案指导 NGS 检测工作流程。 此外,它还显示样品和订单状态的实时概览,其中包含与指定样品及其衍生物相关的每个数据。”

常见问题解答

二代测序 (NGS) 是指用于研究与疾病相关的遗传变异或开展其他生物研究的高通量、大规模平行测序技术。NGS 在链终止测序或桑格测序的基础上进行了改进,桑格测序彻底变革了生物研究,使研究人员首次确定了基因组序列。

NGS 和一代测序的主要区别在于通量。 NGS 在每次运行中可对数百万 DNA 小片段进行平行测序。常规测序或桑格测序使用耗时的分析,每次反应只能解码少数碱基。举个体积和通量改进的例子,NGS 可以在一天内对整个人类基因组进行测序,而用于确定第一个人类基因组的桑格测序方法则需要十多年的时间才能完成解码。NGS 在通量方面的巨大改进还使 DNA 测序成本大幅降低。

所有用于 NGS 的实验室信息管理系统 (LIMS) 都使用户能够更轻松、有效地管理样品和相关数据。对于任何 NGS 工作流程,理想的 LIMS 能够:

  • 助您轻松满足 HIPAA、CLIA、CAP 及其他标准要求
  • 可视化追踪大量的样品数据
  • 与您的 NGS 仪器连接
  • 无需搜索缓慢且缺乏关联的 Excel 数据
  • 自动记录和报告元数据
  • 规划无限的任务
  • 管理三级分析的异构体分析

NGS 是一个复杂的科学过程,包括许多步骤,并通过持续的 QC 检查来确保获得高质量且一致的数据。这些步骤包括:

  • 样品收集
  • 样品前处理
  • 文库制备
  • 靶向序列捕获
  • 测序
  • 数据分析与报告
完整的 NGS 工作流程

LIMS 可以连接整个 NGS 工作流程中使用的所有仪器和软件包,从液体处理器到仪器,再到 NGS 数据分析软件。 其中包括测序仪,该仪器生成大量用于保存和分析的 NGS 数据。然后,LIMS 将查找关键结果,并将其呈现在报告中。

NGS 实验室面临一些共同的挑战,其中许多都可以通过安捷伦产品或解决方案来克服。

  • 挑战:以可重复使用的方式存储数据。解决方案:与常用的电子表格系统(例如 Microsoft Excel)相比,安捷伦 SLIMS 有利于搜索和建立样品、程序和样品结果之间的关联。虽然 Excel 易于使用且用途广泛,但在用于检索信息或构建信息时却不太令人满意
  • 挑战:确保样品质量始终达到一定水平。解决方案:常规 QC 检查可以确保样品质量。 正如 Agilent TapeStation 系统与安捷伦 SLIMS 完全集成那样,集成的自动化样品 QC 是提高 NGS 工作流程效率和易用性的理想选择
  • 挑战:文库制备复杂且容易出错。 解决方案:安捷伦 SLIMS 提供直观的控制和用户指导,以便更轻松、快速地设置方案,同时自动化可以减少污染、错误和每个样品的成本。Agilent Bravo 是灵活的液体处理平台,可实现 NGS 样品前处理的自动化,在节省时间的同时生成一致的数据

为确保合规,NGS 实验室应符合以下标准: HIPAA、CLIA、ISO 13485、ISO/IEC 17025 和 ISO 15189。

NGS 是一种策略,用于同时检测多个基因,从而确定整个基因组或 DNA/RNA 目标区域中核苷酸的顺序。NGS 可用于检测变异或突变。例如,在癌症中,NGS 可应用于已经活检或切除的患者肿瘤。

实时聚合酶链反应 (PCR) 是一种更简单且要求更低的技术,但多重检测能力有限。NGS 允许分析人员同时确定多个基因序列,并揭示具体的变化。但 NGS 是一个比 PCR 的技术要求更高且成本更高的过程。

定量聚合酶链反应 (qPCR) 尤其适用于通量较低且目标分析物数量较少的实验室。NGS 更具可扩展性,更适用于高通量测序,可提供更强的发现能力和更高的灵敏度。

在 DNA 测序发明几十年后,全球共安装了超过 10000 套 NGS 系统。随着二代测序被公认为现行测序方法,实验室当前面临着提供更高的通量和更有条理的数据的挑战。此外,监管机构也发挥了作用,他们要求实验室记录更多的数据,并确保适合长期使用。因此,需要实施一种数字化解决方案,用于管理整个 NGS 工作流程,确保一致性,同时关注分析效率。

通过 SLIMS,除了广泛的 NGS 产品组合外,安捷伦还提供了一种全面的软件解决方案,可对整个实验室工作流程中的所有样品进行管理和追踪。 其中包括在样品收集期间、样品使用前、NGS 文库 QC 和靶向序列捕获期间采取的质量控制措施。SLIMS 还提供了所需的复杂控制,确保数据在未来几年内保持安全存储和可访问性。

可轻松获取试用版。

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